随着农业现代化的不断发展，有机肥在农业生产中的作用重新受到重视，用有机肥种出的农产品口感佳，能够有效保持瓜果蔬菜等本身特有的营养和味道，同时在土壤环境的保护和改良中也起着举足轻重的作用如今有机肥在农业生产中的作用也逐渐被广大群众所认知。

提高土壤培肥地力的作用土壤中的微量元素95%以不溶态形式存在，不能被植物吸收利用，而微生物代谢产物中含有大量的有机酸类物质，这些物质就像在冰块中加入的热水一样，很快就能把微量元素如钙、镁、硫、铜、锌、铁、硼、钼等植物必需的矿物元素溶解，变成可以被植物直接吸收利用的营养元素，大大增加了土壤的供肥能力。

提高土壤质量，促进土壤微生物繁殖有机肥料可以使土壤中的微生物大量繁殖，特别是许多有益的微生物，如固氮菌、氨化菌、纤维素分解菌等.这些有益微生物，能分解土壤中的有机物，增加土壤的团粒结构，改善土壤组成微生物在土壤中的繁殖速度非常快，他们就像一张看不见的大网，错综复杂。

微生物的菌体死亡后，在土壤中留下了很多微细的管道，这些微细的管道不但增加了土壤的透气性，而且还使土壤变得蓬松柔软，养分水分不易流失，增加了土壤蓄水蓄肥能力，避免和消除了土壤的板结有机肥中的有益微生物还能抑制有害病菌的繁殖，这样就可以做到少打药，如果连续多年施用，可以有效抑制土壤有害生物，省工、省钱、无污染。

提供农作物所需全面营养，保护农作物根茎有机肥料含有植物所需要的大量营养成分、微量元素、糖类和脂肪有机肥分解释放的CO2可作为物光合作用的材料同时，不得不提的是有机肥在土壤中分解，能够转化形成各种的腐殖酸是一种高分子物质，具有很好的络合吸附性能，对重金属离子有很好的络合吸附作用，能有效地减轻重金属离子对作物的毒害，并阻止其进入植株中，并且保护植腐殖酸物质物的根茎。

增强农作物抗病、抗旱、耐涝能力有机肥含有维生素、抗生素等，可增强农作物抗性，减轻或防止病害发生有机肥施入土壤后，可增强土壤的蓄水保水能力，在干旱情况下，能增强作物的抗旱能力同时，有机肥还可使土壤变得疏松，改善作物根系的生态环境，促进根系的生长，增强根系活力，提高作物耐涝能力，减少植物的死亡率，提高了农产品的生存率。

提高食品的安全性、绿色性国家早已明文规定：农业生产过程必须限制无机肥料的过量使用，有机肥料才是生产绿色食品的主要肥源由于有机肥料中各种营养元素比较完全，而且这些物质完全是无毒、无害、无污染的自然物质，这就为生产高产、优质、无污染的绿色食品提供了必须条件。

前面说的腐殖酸物质，可以减轻重金属离子对植物的危害，也就相当于减少了重金属对人体的危害提高农作物产量有机肥中的有益微生物利用土壤中的有机质，产生次级代谢物，其中含有大量的促生长类物质如生长素，能促进植物伸长生长，脱落酸能促进果实成熟，赤霉素能促进开花坐果，增加开花数、保果率，提高产量，使果实饱满，色泽鲜嫩，还能提早上市，达到增产增收。

减少养分流失，提高化肥利用率化肥的实际利用率只有30%～45%损失的化肥一部分分解释放到大气中，一部分则随着水土流失掉了，还有一部分被固定在土壤中，不能被植物直接吸收利用当施入有机肥后，由于有益生物活动改善了土壤结构，增加了土壤保水保肥能力，从而减少了养分的流失。

加上有益微生物解磷解钾作用，能使化肥有效利用率提高到50%以上有机肥的优势说明了它的不可替代性，相比化肥，未来人们都会相应的偏向选择有机肥料，有机肥的广泛使用，有效降低农业生产成本，减少环境污染，符合现代农业可持续发展的要求。